Setelah ayah lajang menikah lagi, Keita Suminoe tidak hanya menemukan dirinya sendiri dengan ibu baru, tetapi juga dua saudara perempuan tiri kembar yang cantik, Ako dan Riko. Ikatan dekat mereka sebagai anak-anak segera tumbuh menjadi sesuatu yang lebih pribadi, dan Keita menemukan dirinya dalam ikatan yang nyata sehingga ia berjuang keras untuk melarikan diri.
Untuk si kembar, transisi dari gadis kecil ke remaja membawa perubahan dalam penampilan serta pertumbuhan emosional. Cinta mereka untuk Keita menjadi sesuatu yang lebih dari cinta persaudaraan, karena mereka berdua diliputi perasaan romantis dan nafsu murni. Gadis-gadis tak berdosa ini, menjadi pasangan wanita muda yang jujur, mau tidak mau mengakui cinta mereka yang baru lahir kepada adik lelaki mereka yang malang. Hilaritas terjadi ketika Keita, yang menolak untuk melihat keduanya sebagai hal lain selain saudara perempuannya, kemudian mulai masuk ke dalam situasi yang memalukan, sensual, dan bernafsu bersama mereka. Akankah Keita melewati garis inses atau akankah dia dapat melindungi perhiasan keluarganya?
Kiss x Sis adalah anime harem berisi ecchi yang mungkin membuatmu sedikit malu-malu, tapi itu juga pasti akan membuatmu tertawa.